Il Museo pedagogico è una delle istituzioni più antiche del suo genere in Serbia. Il Museo della Scuola nasce nel 1896 per iniziativa dell'Associazione Insegnanti, con lo scopo di raccogliere e conservare materiale didattico e ogni altro oggetto di importanza storica per le scuole primarie e gli insegnanti. Durante più di un secolo di esistenza sono state raccolte diverse decine di migliaia di libri di testo, sussidi didattici, fotografie e documenti che testimoniano il lavoro delle scuole serbe dall'inizio del XIX secolo fino ad oggi. Nel corso della sua esistenza il Museo si è trasferito più volte e dal 1969 è ospitato nell'edificio della Realka di Belgrado, costruito intorno al 1840, cioè nella casa di Cvetko Rajović, allora amministratore della città di Belgrado.
Dimitrije J. Putniković (1859-1910), insegnante e scrittore di libri di testo, fu il primo direttore del Museo. La cerimonia di apertura ebbe luogo nella Scuola Elementare vicino alla Cattedrale, il 24 novembre 1896 (secondo il vecchio calendario), nel giorno del centenario della nascita di Jovan Gavrilović. All'inizio del XX secolo il Museo conteneva documenti preziosi per la storia della scuola e dell'educazione serba, ma durante la prima guerra mondiale tutto fu distrutto.
Nel dopoguerra, a partire dal 1925, il Museo continuò la sua attività nell'edificio del Dormitorio dei Maestri dove, in tre grandi sale, venne allestita un'esposizione con reperti classificati per argomento. I visitatori, studenti e insegnanti, hanno potuto vedere collezioni di insetti, preparati zoologici, immagini didattiche, disegni, mappe in rilievo e lavori degli studenti.
Durante la Seconda Guerra Mondiale il Museo venne nuovamente distrutto. Dopo la guerra, nel 1947, il Museo fu ricostruito e ospitato nell'edificio della scuola elementare di Sveti Sava. La nuova concezione di lavoro e di organizzazione del Museo cominciò ad essere attuata dopo il 1960, quando il Museo della Scuola cambiò nome in Museo Pedagogico. L'attività del Museo venne suddivisa in più settori e le collezioni museali si arricchirono. In quel periodo il Museo stabilì contatti con istituzioni simili a Zagabria e Lubiana e insieme a loro pubblicò per molti anni la "Raccolta di storia della scuola e dell'educazione". Nel 1969 il Museo fu trasferito nell'edificio Realka, dove nel 1975 fu inaugurata la mostra permanente intitolata "Dieci secoli della scuola serba". Le condizioni di lavoro migliorarono notevolmente, il che contribuì a trasformare il Museo in una moderna istituzione culturale.
Ora il Museo raccoglie oggetti e documenti relativi alla storia dell'educazione, dell'educazione e della pedagogia in Serbia. Il team di esperti del Museo presenta i risultati delle proprie ricerche attraverso l'esposizione permanente e in mostre tematiche, nonché attraverso cataloghi e pubblicazioni. Alla fine del 2007 nel Museo Pedagogico è stata riaperta una nuova mostra permanente, che in modo attraente illustra il complesso tema dello sviluppo storico dell'istruzione e dell'istruzione in Serbia e tra i serbi dalle origini fino ai giorni nostri. .
Inoltre, il Museo organizza conferenze, seminari, workshop e altre forme di eventi culturali ed educativi.
Nel Museo Pedagogico sono conservati più di 50.000 oggetti, ovvero libri, fotografie, sussidi didattici, documenti e altri materiali, che rappresentano un tesoro di informazioni sullo sviluppo della scolarizzazione e dell'istruzione in Serbia. Tutti gli oggetti esposti sono raggruppati in diverse collezioni: Collezione di libri di testo e letteratura pedagogica, Collezione di attrezzature scolastiche e sussidi didattici, Collezione di documentazione scolastica e mediateca e Collezione di materiale e documenti d'archivio. Da menzionare anche l'attività editoriale del Museo, cioè le pubblicazioni che trattano dello sviluppo dell'istruzione in Serbia e tra i serbi in un periodo più lungo di due secoli.